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Der Schein (oder Anschein) ist in diesem Zusammenhang der äußere Eindruck, also eine Beobachtung, auf die man sich nicht immer verlassen kann. Das Sein ist dagegen die gesicherte Tatsache, also die Wahrheit.

• Allem Anschein nach ist das so.
• Das erscheint mir richtig.
• Er ist anscheinend nicht von hier.

⇒ Die Aussage leitet sich aus einer äußeren Beobachtung ab, und man hält diese Aussage für zutreffend. Es gibt aber einen kleinen Zweifel, weil sie nicht genauer überprüft wurde.

• Scheinbar hat er das gemacht.
• Die Sonne kreist scheinbar um die Erde.
• Die Zeit scheint stillzustehen.
• Ich sage dir, der Schein trügt.

⇒ Die äußere Beobachtung führt zu einer Aussage, von der aber schon bekannt ist, dass sie nicht zutrifft.

• Das ist aber eher unwahrscheinlich.

⇒ Eine zuvor gemachte Aussage könnte zwar zutreffen, aber die Wahrscheinlichkeit dass sie nicht zutrifft ist größer.

Die Verwechslung von "anscheinend" und "scheinbar" findet man häufig. Das erste drückt aber eine begründete Vermutung aus, das zweite dagegen einen Widerspruch zwischen dem äußeren Eindruck und der Wahrheit.
→ Hier ist ein kurzer Artikel dazu.